负担得起的基因组“应对疾病的关键”的分析

[内罗毕]项目为研究人员提供廉价且可访问的方法，用于研究大量细菌的遗传材料疾病对于解决未来的全球可能至关重要健康科学家说，挑战。

这10,000个沙门氏菌基因组项目（10KSG）可以使细菌基因组数据在低收入和中等收入经济体中更容易获得，尤其是在撒哈拉以南非洲，在非洲77,000例全球年死亡中，有80％的非肾脏沙门氏菌血液感染发生。

由厄尔汉姆研究所（Earlham Institute）和英格兰利物浦大学（University of Liverpool）领导的16个国家的科学家的合作旨在了解对非洲和拉丁美洲的沙门氏菌血液感染负责的细菌菌株的基因组成。这可以增加对细菌耐药性和毒力的理解，并有助于疫苗的开发。

“基因组流行病学研究的良好数据必须充分了解公共卫生政策。”

厄尔勒姆学院尼尔·霍尔（Neil Hall）

“传染病在低收入和中等收入国家造成了巨大的健康和经济负担，”生命科学研究中心Earlham Institute主任尼尔·霍尔（Neil Hall）说。

“通常，最有效的干预措施涉及公共卫生措施。但是，公共卫生政策需要很好地了解数据来自基因组流行病学研究。”

在不到一年的时间里，科学家以每个基因组或遗传物质的10美元的价格分析了来自非洲和拉丁美洲的10,000个沙门氏菌基因组。

根据研究人员的说法，到目前为止，全球仅几个测序中心仅进行了大规模的细菌基因组分析，每个基因组的成本高达100美元。

霍尔解释说，10KSG项目大大降低了成本，并增加了对微生物中存在的遗传材料的大规模研究，使更多的科学家能够进入技术全世界。

利物浦大学的微生物发病机理教授杰伊·辛顿（Jay Hinton）说，要使任何疫苗有效，有必要更多地了解引起疾病的细菌。

“我们的项目提供了对沙门氏菌近年来，包括刚果民主共和国，冈比亚，马里，马拉维，肯尼亚，肯尼亚和乌干达在内的非洲国家感染的变体，这些信息对于评估[沙门氏菌]疫苗推出的影响将是无价的，” Hinton解释说。

肯尼亚医学研究所（KEMRI）的分子生物学家达马里斯·马托克·穆希亚（Damaris Matoke-Muhia）说，接受测序的人们可以培训其他人，以建立合格的劳动力。

“一旦设施配备了测序工具，它​​将有助于连续测序感兴趣的基因组，这将停止由于缺乏能力而进行的样品的运输，包括测序SARS-COV-2变体，” Matoke--穆希亚告诉scidev.net。

她说，降低测序的成本很重要，因为它打开了筛查细菌并开发特定且高度敏感的诊断工具的机会。

这件作品由Scidev.net的撒哈拉以南非洲英语桌子制作。